Без лишней скромности,Питер это непросто "большой город",а действительно мегаполис и как минимум картой лучше разжиться заранее.Ну а по времени,трафик у нас непредсказуемый,пробка может возникнуть в лубой момент в любом месте,в том числе и глубокой ночью.Конечно наиболее напряженное время на выезд из города вечер,в особенности пятница.Ну на вьезд утро и вечер воскресенья.

Не вижу припятствий!(с)

Два дня конечно маловато,но тут главное,как временем распорядится и что кому нравится.Основные достопримечательности компактно расположенны,Дворцовая площадь,Эрмитаж,Адмиралтейство,Кунсткамера,Военноморской и Зоологический музеи,Петропавловская крепость все это рядом.От пристани у Эрмитажа можно до Петродворца с его фонтанами отправится на "Ракете",а можно тудаже поехать на автобусе,только желательно чтоб это еще и обзорная экскурсия по городу была,автобусы постоянно от ст.метро Гостинный двор отправляются по разным направлениям..По рекам и каналам сейчас много путешествий предлагают,за одну такую экскурсию с воды можно многое увидеть.Много еще что можно увидеть цирк,зоопарк кому что нравится.
А по дням недели,наверно лучше суббота/воскресенье в городе свободней и движение и вообще людей меньше- за город разезжаются.

распологаться будем скорее всего на Лиговке

Хороший выбор и центр рядом и на вьезд/выезд из города удобно.

Я еще по маршруту хотел уточнить.У вас Сортавала после Петрозаводска стоит,может есть смысл из Питера пойти на Сортавалу,через Приозерск,а уже от туда на Петрозаводск.Из Карелии когда пойдете сразу за Лодейным полем на Кириши,а так У вас получается Сортавала какбы тупиковый пункт,потом возвращаться приходится.
И еще по Москве,лучше дальним кругом ее обойти в Клину на право в сторону Рузы,потом можно на Серпухов,а некоторые и через Калугу идут,а то в Москве бывает и день люди теряют,я в последнее время, всегда в Клину сворачиваю.